JNE berkomitmen untuk meningkatkan jumlah zakat setiap tahun dan juga memberikan tambahan untuk non-muslim yang membutuhkan. Direktur JNE, Hui Chandra Fireta, dan Edi Santoso mengikuti jejak pendiri dengan membiayai kegiatan keagamaan dan terus mendukung yatim piatu dan orang-orang terlantar, mengikuti ajaran yang ditekankan oleh pendiri, Pak Soeprapto Suparno.